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基于SNP的连锁不平衡分析.pdf
- )1.SNPs5SNP SNPAACACGATCCGCCATGATATCAGTGACCGTAAACACGATTCGCCATGATATCAATGACCGTASNPs5 SNPs ,C- TG- G-C)
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SNP检索_论文-医学论文.doc
- SNP基因序列的检索（图）点击次数：62 发表于：2008-07-22 10:52 转载请注明来自丁香园 来源： HYPERLINK "" 丁香园以检索NAT
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[基础医学]如何进行标签SNPTag SNP的选择haploview与hapmap.pdf
- [基础医学]如何进行标签SNPTag SNP的选择haploview与hapmap
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a better description is needed that includes the tagging algorithm, the ld(r2) cut-off and the version of the hapmap chb reference data used. 用 hapmap 载入基因后，用 haploview 来选 tag snp 的，但是发现和某些文献报道的 tag snp 不同， 这个很正常，在参数不改变的前提下，haploview 选择 tagsnp 存在一定的随机性。例如，假设位点 a， b，c，d 处于同一个单倍域内，通过运行 haploview 的 tagger program，你会发现 a 被选为 tagsnp， 并且位点 a 可以 capture 位点 b,c,d。但是如果你再运行一次 tagger program，可能位点 b 被选择为 tagsnp。在这种情况下，你其实可以选择 a,b,c,d 中任何一个位点作为 tagsnp（理想状态下） 。在这里， 如果位点 a 是一个导致氨基酸改变的 snp 位点， 或者有功能研究认为该位点存在一定的功能时， 你最好 选择该位点，这样有利于你文章的讨论部分的说明。 貌似在运行“run tagger”前将 r2 值设定为 1，就可 以了。 hapmap 上的数据一直在更新，所以如果你根据 hapmap 上的数据来选择 tagsnp，必须提供数据库的版本 号码：具体查询版本号的方法如图所示. tagging algorithm 指的是什么？是什么公式啊？这是我投稿后审稿人给的我修稿意见。他的意思是让我从 这几方面描述如何选择 tagging snps： a better description is needed that includes the tagging algorithm, the ld(r2) cut-off and t
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- 期，第125-133页Molecular Plant Breeding, 2010, Vol.8, No.1, 125-133评述与进展Review 中国科学院上海植物生理生态研究所,植物分子遗传国家
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向豆丁求助：有没有snp?
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