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基因序列分析软件DNAStar简介.pdf
生物信息基因序列分析软件DNAStar简介 (福建省农科院生物技术中心)1.设计公司 Sequence Analysis Software Windows,GETTINGSTARTED,Introdu
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人类基因序列的可专利性及相关法律问题论文.doc
华中科技大学硕士学位论文 人类基因序列的可专利性及相关法律问题 姓名:陈建志 申请学位级别:硕士 专业:民商法 指导教师:郑平安 20080601 华中科技大学硕士学位论文 基因技术的迅速发展使专利法
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对一条新的基因序列进行生物信息学的分析.doc
对一条新的基因序列进行生物信息学的分析海南中学 作者:许汝言 指导老师:黄小葵论文摘要本研究的主要内容是运用生物信息学的手段结合生物学实验方法对从一株产-甘露聚糖酶的新菌种A.tabescens EJ
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基因序列拼接算法的研究.pdf
中南大学硕士学位论文基因序列拼接算法的研究姓名:王磊申请学位级别:硕士专业:计算机软件与理论指导教师:张祖平20060420摘要生物信息学是一门综合利用生物学、计算机科学、数学等学科知识的新兴交叉学科
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基因序列分析.doc
在获得一个基因序列后,需要对其进行生物信息学分析,从中尽量发掘信息,从而指导进一步的实验研究。通过染色体定位分析、内含子/外显子分析、ORF分析、表达谱分析等,能够阐明基因的基本信息。通过启动子预测、
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如何查找基因序列.ppt
如何查找基因序列如何查找基因序列GenBank GenBank GenBank GenBank--- ---序列数据库 序列数据库 包括 包括EMBL EMBL和和DDBJ DDBJ 是是NIH NI
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基因序列分析摘要 针对问题一,根据原始给出的 HIV 的基因片段 HIV1_GENOME_DNA.fasta ,以及对其中一个编码蛋白质基因的序列 HIV1_ENV_DNA.fasta 的分析,采用多
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基因序列拼接算法设计.pdf
27卷第5期    计算机应用与软件 Vol127 No. 52010年 5月   Computer Applications SoftwareMay 2010基因序列拼接算法设计刘国庆1 曾艳丽2 
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基因序列拼接算法的研究.pdf
生物信息学是一门综合利用生物学、计算机科学、数学等学科知识的新兴交叉学科,其主要任务是揭示海量生物学数据中蕴含的生物学意义、探索生命活动的奥秘。全基因组DNA序列拼接是生物信息学研究的重要课题。在大规模DNA测序中普遍使用的Shotgun方法中,片段序列的拼接是一个关键而又费时的过程,其中包含了一些实际困难,重复子序列对片段间正确重叠的干扰就是其中一个。如何提高序列拼接的精度和速度是本课题研究的重点。 本文在深入分析现有拼接算法及其实现软件的基础上,针对分布式并行计算环境,提出了优化的DNA序列拼接并行算法P Assembler,分别对序列拼接中的Overlap、Layout和Consensus阶段的串行处理过程和并行算法进行了探讨,通过分析数据集的划分方法和串行处理过程的可并行性,提出了多种不同的并行处理策略并加以比较与分析,理论和实验结果都验证了并行处理后序列拼接算法效率大大提高。除此之外,论文针对DNA序列拼接中比较棘手的重复序列问题,提出了一种改进的基于k-mer子串的重复序列识别方法KmerRepeat,实验结果表明:和已有聚类和ARACHNE分析方法相比,具有更高的精确性,也在一定程度上提高了序列拼接效率。 论文对算法的实现及其拼接软件的测试结果也作了深入的分析,实验结果表明算法是可行的且高效的。
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用NCBI查找基因序列教程.doc
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